吉林大学研究生院建于1984年6月，是经国务院批准的全国22所重点大学首批试办的研究生院之一。1996年3月，经原国家教委批准又成为首批正式建院的研究生院之一。 吉林大学研究生教育起步较早，1949年开始招收研究生班，1952年开始招收三年制研究生，1978年开始培养学位研究生。 1985年10月，经国务院批准，吉林大学成为首批建立博士后科研流动站的单位之一。